Dans la partie francophone du canton, la 7e, la 8e et la 9e années sont regroupées dans des établissements secondaires. Les élèves y sont en " section générale ", en " section moderne " ou en " section préparant aux écoles de maturité ".
Dans la partie germanophone du canton, les élèves de la 7e à la 9e année scolaire suivent une école générale, une école secondaire ou encore une école dans laquelle sont regroupés des élèves des deux types d'école. Chaque commune est libre d'opter pour la forme d'enseignement qui lui convient : classes générales et classes secondaires séparées ou réunies. Les plans d'études sont pratiquement les mêmes pour les écoles générales et pour les écoles secondaires, sauf qu'à l'école secondaire, les exigences sont plus élevées qu'à l'école générale. L'enseignement gymnasial débute en 9e année. En fonction de la commune, il a lieu dans une école secondaire ou dans une école de maturité.
Le passage au cycle secondaire I
En 5e et 6e années, des travaux d'évaluation comparative sont effectués afin d'orienter les élèves vers la classe / section du secondaire I correspondant à leur niveau de performance. Une proposition commune est ensuite formulée lors d'un entretien réunissant le personnel enseignant, les parents et l'élève. La décision d'orientation est prise par la commission de l'école primaire dont vient l'élève. Le premier semestre de la 7e année est un semestre probatoire.