Le nom de Court apparaît pour la première fois dans un document du pape Eugène III datant du 17 mai 1148 (Cort) puis dans un acte du pape Alexandre III, du 27 février 1179 (Curt) et finalement Court (1461). On y fait mention de Chavanney situé à l'entrée du vallon de Chaluet et de Minvillier, localité plus grande que Court, sise dans le vallon à l'Ouest du temple actuel.
Le village dépendit de la mairie de Malleray jusqu'en 1646, puis de celle de Tavannes. Court fit partie de la paroisse de Minvilier jusqu'à la disparition de ce village, causée par la peste au 17e siècle.
Des mines de fer furent exploitées dès le Moyen Âge. Des travaux en vue de l'exploitation de couches de sable vitrifiable, ont été entrepris à l'entrée des Gorges de Court alors que des marmites glacières et deux blocs erratiques provenant de la vallée de Bagnes et de la dent du Midi ont été découverts.
«Vu du pont de la Birse, étroit passage près le Moutier-Grandval»,
gravure sur cuivre de Le Grand, dessiné par Alexis-Nicolas Perignon, 1780-1788.